「日本料理きじま　みなとみらい店」は有機・自然栽培農産物の利用も促進している。米は100％自然栽培、薬品処理していない非遺伝子組み換えの国産菜種油や国産有機米100％の有機純米酢など、化学調味料・各種添加物を一切使用しない昔ながらの発酵調味料に切り替えた。これらの食材を使用した会席料理やお弁当、和惣菜はオンラインでも販売可能。